Hackathon sur données
L’association InterHop organisera la deuxième édition de son hackathon sur données (Datathon) en septembre 2025.
Un datathon est un événement qui réunit, sur quelques jours, des spécialistes du traitement des données, des professionnel·les de santé et des patient·es pour travailler de façon collaborative sur des projets de programmation informatique et d’analyse de données.
Durant deux à trois jours, des équipes pluridisciplinaires travaillent intensivement afin de développer une solution répondant à une problématique spécifique de recherche en santé.
Le Datathon s’adresse à tous les acteurs impliqués dans le domaine de la santé numérique : professionnel·les de santé, patient·es, ingénieurs et data scientists. Aucune expérience préalable en programmation informatique n’est requise pour participer. L’objectif principal est de favoriser les échanges, le partage d’xpertise et de renforcer les liens entre ces différents acteurs autour des données de santé.
Voici une vidéo de présentation du datathon des hôpitaux de Paris de 2018 co-organisé avec la Société Française d’Anesthésie et de Réanimation (SFAR) et la Société de Réanimation de Langue Française (SRLF).
Découvrez la photographie des participant·es à la première édition du datathon InterHop de septembre 2024.
Le Datathon aura lieu à la Maison Des Associations de Rennes, 6 Cours des Alliés à 35000 Rennes.
Il commencera le jeudi 11 septembre 2025 à 9h et finira le vendredi 12 septembre à 18h.
Voici le programme plus en détails :
InterHop mettra à disposition LibreDataHub, logiciel LinkR (disponible sur un simple navigateur) ainsi que des serveurs pour réaliser les traitements de données. N’oubliez pas d’apporter votre ordinateur personnel !
Les frais de location de la salle et des serveurs sont pris en charge par l’association InterHop. Nous vous demanderons une participation pour les repas du midi et du soir. Les frais de transports et de logement restent à votre charge.
Chacun·une est libre de venir avec ses propres sujets.
À titre d’exemple voici une liste des sujets ayant été traités l’année dernière : https://interhop.org/2024/06/26/datathon-sujet
La principale source de données utilisée sera la base de données MIMIC au format OMOP1.
Le modèle commun de donnée OMOP2 et notre plateforme Low Code de Data Science LinkR seront de la partie.
Dans son format complet elle contient plus de 45000 patient·es hospitalisé·es en réanimation.
Dans ce format il est nécessaire de passer un diplome s’appelant le CITI : https://physionet.org/about/citi-course/
Il faut donc :
Ces étapes sont obligatoires pour avoir avoir accès à la version complète de MIMIC-OMOP.
Si vous ne souhaitez pas prendre du temps pour passer ce diplôme vous pourrez tout de même avoir accès à MIMIC. :-)
Par contre nous vous mettrons à disposition un jeu de patient·es restreint ; contenant une centaine de patient·es seulement.
Aussi si vous souhaitez utiliser un autre jeu de données le CITI n’est évidemment pas nécessaire.
Pour vous inscrire il suffit de remplir ce questionnaire en ligne : https://goupile.interhop.org/datathon.
Rejoignez-nous aussi sur messagerie d’équipe Element ! Voici fil de discussion public dédié au Datathon : https://matrix.to/#/#datathon:matrix.interhop.org